Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1Q5M775 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1Q5M775 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPECC1Q5M775 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPECC1Q5M775 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms