Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MS4A13Q5J8X5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MS4A13Q5J8X5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A13Q5J8X5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A13Q5J8X5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms