Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJH7

YIF1B, Protein YIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1BQ5BJH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIF1BQ5BJH7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIF1BQ5BJH7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIF1BQ5BJH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIF1BQ5BJH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms