Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL22Q53GT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL22Q53GT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL22Q53GT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL22Q53GT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL22Q53GT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL22Q53GT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms