Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SVEP1Q4LDE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVEP1Q4LDE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVEP1Q4LDE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVEP1Q4LDE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms