Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H1Q32P28 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P3H1Q32P28 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H1Q32P28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms