Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPRED3Q2MJR0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPRED3Q2MJR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRED3Q2MJR0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms