Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms