Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IMPG1Q17R60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IMPG1Q17R60 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMPG1Q17R60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMPG1Q17R60 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms