Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCK2Q16822 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCK2Q16822 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCK2Q16822 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms