Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
FOXD1Q16676 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FOXD1Q16676 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
FOXD1Q16676 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
FOXD1Q16676 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
FOXD1Q16676 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FOXD1Q16676 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms