Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRR4Q16378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRR4Q16378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRR4Q16378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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