Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A5Q15758 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A5Q15758 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A5Q15758 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms