Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLCA4Q14CN2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA4Q14CN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA4Q14CN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCA4Q14CN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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