Protein–RNA interactions for Protein: Q14240

EIF4A2, Eukaryotic initiation factor 4A-II, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A2Q14240 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EIF4A2Q14240 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EIF4A2Q14240 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
EIF4A2Q14240 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EIF4A2Q14240 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EIF4A2Q14240 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A2Q14240 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms