Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSTF3Q12996 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF3Q12996 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF3Q12996 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSTF3Q12996 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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