Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4Q12950 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4Q12950 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4Q12950 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4Q12950 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8377.8 ms