Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BPTFQ12830 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BPTFQ12830 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BPTFQ12830 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BPTFQ12830 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPTFQ12830 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms