Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DHX9Q08211 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DHX9Q08211 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DHX9Q08211 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms