Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX8Q06710 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX8Q06710 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX8Q06710 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms