Protein–RNA interactions for Protein: Q05084

ICA1, Islet cell autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICA1Q05084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ICA1Q05084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ICA1Q05084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ICA1Q05084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ICA1Q05084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ICA1Q05084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ICA1Q05084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms