Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.087e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-220ENST00000531540 480 ntTSL 28.22□□□□□ -1.097e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 HMGB1-207ENST00000468384 503 ntTSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.197e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-207ENST00000530570 544 ntTSL 27.24□□□□□ -1.257e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-209ENST00000533925 533 ntTSL 46.59□□□□□ -1.357e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.447e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.637e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.787e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 527.89■■■□□ 2.058e-7■■■■□ 25.3
FKBP4Q02790 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 524.86■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 321.44■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 521.44■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 324.58■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 419.99■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 418.15■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 25.1
FKBP4Q02790 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 UVSSA-203ENST00000503548 4819 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 25
FKBP4Q02790 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 25
FKBP4Q02790 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 516.59■□□□□ 0.255e-7■■■■□ 25
FKBP4Q02790 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 25
FKBP4Q02790 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 25
FKBP4Q02790 PRR7-AS1-201ENST00000425316 741 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-6■■■■□ 24.9
FKBP4Q02790 PRR7-AS1-202ENST00000506465 421 ntTSL 38.58□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 24.9
FKBP4Q02790 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 414.94□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 24.9
FKBP4Q02790 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 335.76■■■■□ 3.321e-6■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.571e-6■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.921e-6■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 235.06■■■■□ 3.29e-7■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 335.06■■■■□ 3.29e-7■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.029e-7■■■■□ 24.8
FKBP4Q02790 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 527.39■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 24.7
FKBP4Q02790 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 323.73■■□□□ 1.391e-6■■■■□ 24.7
FKBP4Q02790 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 433.5■■■□□ 2.954e-6■■■■□ 24.6
FKBP4Q02790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.044e-6■■■■□ 24.6
FKBP4Q02790 CSNK1G2-204ENST00000589350 780 ntTSL 521.77■■□□□ 1.083e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 CSNK1G2-210ENST00000614707 249 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.721e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.241e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.171e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.871e-6■■■■□ 24.5
FKBP4Q02790 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 524.35■■□□□ 1.496e-7■■■■□ 24.4
FKBP4Q02790 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 517.42■□□□□ 0.386e-7■■■■□ 24.4
FKBP4Q02790 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 224.12■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 24.3
FKBP4Q02790 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 428.53■■■□□ 2.162e-6■■■■□ 24.3
FKBP4Q02790 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 424.78■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 24.3
FKBP4Q02790 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 423.07■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.3
FKBP4Q02790 SLC16A3-204ENST00000578522 535 ntTSL 421.76■■□□□ 1.071e-11■■■■□ 24.3
FKBP4Q02790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.864e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.74e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.964e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.784e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 525.42■■□□□ 1.664e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.531e-8■■■■□ 24
FKBP4Q02790 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-8■■■■□ 24
FKBP4Q02790 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-8■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 216.4■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24
FKBP4Q02790 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-8■■■■□ 24
FKBP4Q02790 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 23.8
FKBP4Q02790 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 318.65■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 23.8
FKBP4Q02790 SPHK1-206ENST00000590379 588 ntTSL 326.62■■□□□ 1.852e-7■■■■□ 23.7
FKBP4Q02790 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.133e-6■■■■□ 23.7
FKBP4Q02790 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 23.7
FKBP4Q02790 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 23.7
FKBP4Q02790 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 528.16■■■□□ 2.14e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.584e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.324e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 323.11■■□□□ 1.294e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.064e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-205ENST00000524570 1934 ntTSL 220■□□□□ 0.794e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-212ENST00000528320 922 ntTSL 219.64■□□□□ 0.734e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 219.64■□□□□ 0.734e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 318.94■□□□□ 0.624e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 318.29■□□□□ 0.524e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 217.51■□□□□ 0.394e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.344e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.224e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 PUF60-210ENST00000527584 547 ntTSL 211.97□□□□□ -0.494e-12■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 528.02■■■□□ 2.081e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 415.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 313.48□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 23.5
FKBP4Q02790 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 410.55□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 23.5
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 49.2 ms