Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OC90Q02509 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OC90Q02509 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OC90Q02509 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OC90Q02509 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OC90Q02509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OC90Q02509 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OC90Q02509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OC90Q02509 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OC90Q02509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OC90Q02509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OC90Q02509 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OC90Q02509 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OC90Q02509 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OC90Q02509 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OC90Q02509 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OC90Q02509 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OC90Q02509 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OC90Q02509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OC90Q02509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OC90Q02509 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OC90Q02509 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OC90Q02509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OC90Q02509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OC90Q02509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OC90Q02509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OC90Q02509 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OC90Q02509 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OC90Q02509 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OC90Q02509 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OC90Q02509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OC90Q02509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OC90Q02509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OC90Q02509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OC90Q02509 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OC90Q02509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OC90Q02509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OC90Q02509 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OC90Q02509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OC90Q02509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OC90Q02509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OC90Q02509 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OC90Q02509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OC90Q02509 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OC90Q02509 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OC90Q02509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OC90Q02509 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OC90Q02509 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OC90Q02509 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OC90Q02509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OC90Q02509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OC90Q02509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OC90Q02509 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OC90Q02509 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OC90Q02509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OC90Q02509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OC90Q02509 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OC90Q02509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OC90Q02509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OC90Q02509 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OC90Q02509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OC90Q02509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OC90Q02509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OC90Q02509 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OC90Q02509 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OC90Q02509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OC90Q02509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OC90Q02509 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OC90Q02509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OC90Q02509 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OC90Q02509 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OC90Q02509 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OC90Q02509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OC90Q02509 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms