Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC42EP1Q00587 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC42EP1Q00587 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC42EP1Q00587 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC42EP1Q00587 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms