Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNAQ00169 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITPNAQ00169 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITPNAQ00169 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PITPNAQ00169 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITPNAQ00169 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms