Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBP5P82980 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBP5P82980 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBP5P82980 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBP5P82980 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBP5P82980 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBP5P82980 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBP5P82980 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBP5P82980 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBP5P82980 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBP5P82980 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBP5P82980 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBP5P82980 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBP5P82980 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBP5P82980 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBP5P82980 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBP5P82980 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBP5P82980 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBP5P82980 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBP5P82980 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBP5P82980 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBP5P82980 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBP5P82980 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBP5P82980 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBP5P82980 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBP5P82980 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBP5P82980 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBP5P82980 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBP5P82980 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBP5P82980 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBP5P82980 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBP5P82980 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBP5P82980 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RBP5P82980 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RBP5P82980 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RBP5P82980 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBP5P82980 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBP5P82980 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBP5P82980 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RBP5P82980 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RBP5P82980 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RBP5P82980 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBP5P82980 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBP5P82980 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBP5P82980 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBP5P82980 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBP5P82980 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBP5P82980 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBP5P82980 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBP5P82980 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBP5P82980 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBP5P82980 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBP5P82980 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBP5P82980 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBP5P82980 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBP5P82980 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBP5P82980 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBP5P82980 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBP5P82980 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBP5P82980 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBP5P82980 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBP5P82980 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBP5P82980 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBP5P82980 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBP5P82980 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBP5P82980 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms