Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP2P81877 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSBP2P81877 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP2P81877 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP2P81877 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms