Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL20P78556 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL20P78556 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL20P78556 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCL20P78556 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL20P78556 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL20P78556 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL20P78556 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL20P78556 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL20P78556 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL20P78556 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL20P78556 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL20P78556 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL20P78556 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL20P78556 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL20P78556 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL20P78556 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL20P78556 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL20P78556 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL20P78556 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL20P78556 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL20P78556 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL20P78556 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL20P78556 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL20P78556 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL20P78556 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL20P78556 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL20P78556 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL20P78556 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL20P78556 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL20P78556 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL20P78556 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL20P78556 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL20P78556 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL20P78556 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL20P78556 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL20P78556 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL20P78556 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL20P78556 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL20P78556 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL20P78556 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL20P78556 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL20P78556 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL20P78556 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL20P78556 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL20P78556 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL20P78556 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL20P78556 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL20P78556 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL20P78556 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL20P78556 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL20P78556 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL20P78556 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL20P78556 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL20P78556 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL20P78556 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL20P78556 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL20P78556 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL20P78556 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL20P78556 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL20P78556 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL20P78556 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL20P78556 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL20P78556 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms