Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBA52P62987 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBA52P62987 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBA52P62987 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBA52P62987 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBA52P62987 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBA52P62987 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBA52P62987 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBA52P62987 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBA52P62987 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBA52P62987 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBA52P62987 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBA52P62987 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBA52P62987 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBA52P62987 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBA52P62987 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA52P62987 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA52P62987 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA52P62987 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA52P62987 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBA52P62987 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBA52P62987 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBA52P62987 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBA52P62987 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA52P62987 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA52P62987 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBA52P62987 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA52P62987 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA52P62987 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBA52P62987 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA52P62987 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA52P62987 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA52P62987 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBA52P62987 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA52P62987 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA52P62987 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA52P62987 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA52P62987 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBA52P62987 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBA52P62987 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBA52P62987 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBA52P62987 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBA52P62987 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBA52P62987 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBA52P62987 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBA52P62987 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBA52P62987 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBA52P62987 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBA52P62987 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBA52P62987 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBA52P62987 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBA52P62987 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBA52P62987 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBA52P62987 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBA52P62987 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA52P62987 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA52P62987 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA52P62987 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA52P62987 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA52P62987 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA52P62987 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA52P62987 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA52P62987 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms