Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2LP62875 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2LP62875 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2LP62875 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2LP62875 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2LP62875 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms