Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME3P61289 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME3P61289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME3P61289 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME3P61289 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME3P61289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME3P61289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME3P61289 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME3P61289 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSME3P61289 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME3P61289 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME3P61289 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME3P61289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME3P61289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME3P61289 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME3P61289 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME3P61289 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME3P61289 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME3P61289 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME3P61289 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME3P61289 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME3P61289 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME3P61289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSME3P61289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME3P61289 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME3P61289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSME3P61289 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME3P61289 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME3P61289 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSME3P61289 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME3P61289 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME3P61289 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSME3P61289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSME3P61289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME3P61289 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME3P61289 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME3P61289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME3P61289 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME3P61289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME3P61289 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME3P61289 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME3P61289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME3P61289 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME3P61289 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME3P61289 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME3P61289 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME3P61289 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME3P61289 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME3P61289 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME3P61289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME3P61289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME3P61289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME3P61289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME3P61289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME3P61289 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME3P61289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME3P61289 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME3P61289 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME3P61289 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME3P61289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME3P61289 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME3P61289 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME3P61289 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME3P61289 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME3P61289 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME3P61289 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME3P61289 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSME3P61289 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms