Protein–RNA interactions for Protein: P61160

ACTR2, Actin-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR2P61160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTR2P61160 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTR2P61160 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTR2P61160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTR2P61160 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ACTR2P61160 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTR2P61160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTR2P61160 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms