Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAP25P60880 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAP25P60880 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SNAP25P60880 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAP25P60880 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP25P60880 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP25P60880 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAP25P60880 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms