Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3EP60228 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3EP60228 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3EP60228 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3EP60228 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3EP60228 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms