Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01547P58512 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms