Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
JAM2P57087 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
JAM2P57087 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
JAM2P57087 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
JAM2P57087 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
JAM2P57087 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
JAM2P57087 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
JAM2P57087 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
JAM2P57087 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
JAM2P57087 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
JAM2P57087 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
JAM2P57087 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
JAM2P57087 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
JAM2P57087 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
JAM2P57087 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
JAM2P57087 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
JAM2P57087 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
JAM2P57087 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
JAM2P57087 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
JAM2P57087 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
JAM2P57087 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
JAM2P57087 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
JAM2P57087 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
JAM2P57087 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
JAM2P57087 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
JAM2P57087 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
JAM2P57087 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
JAM2P57087 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
JAM2P57087 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
JAM2P57087 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
JAM2P57087 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
JAM2P57087 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
JAM2P57087 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
JAM2P57087 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
JAM2P57087 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
JAM2P57087 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
JAM2P57087 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
JAM2P57087 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
JAM2P57087 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
JAM2P57087 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
JAM2P57087 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
JAM2P57087 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
JAM2P57087 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
JAM2P57087 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
JAM2P57087 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
JAM2P57087 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
JAM2P57087 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
JAM2P57087 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
JAM2P57087 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
JAM2P57087 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
JAM2P57087 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
JAM2P57087 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
JAM2P57087 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
JAM2P57087 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
JAM2P57087 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
JAM2P57087 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
JAM2P57087 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
JAM2P57087 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
JAM2P57087 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
JAM2P57087 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
JAM2P57087 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
JAM2P57087 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
JAM2P57087 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
JAM2P57087 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
JAM2P57087 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
JAM2P57087 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
JAM2P57087 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
JAM2P57087 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
JAM2P57087 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
JAM2P57087 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
JAM2P57087 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
JAM2P57087 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
JAM2P57087 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
JAM2P57087 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
JAM2P57087 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
JAM2P57087 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
JAM2P57087 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
JAM2P57087 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
JAM2P57087 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms