Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H2BFSP57053 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2BFSP57053 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2BFSP57053 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2BFSP57053 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2BFSP57053 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2BFSP57053 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2BFSP57053 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2BFSP57053 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2BFSP57053 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2BFSP57053 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2BFSP57053 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms