Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAV3P56539 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAV3P56539 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAV3P56539 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAV3P56539 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAV3P56539 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAV3P56539 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAV3P56539 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAV3P56539 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAV3P56539 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAV3P56539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAV3P56539 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAV3P56539 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV3P56539 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV3P56539 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV3P56539 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV3P56539 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV3P56539 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV3P56539 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV3P56539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV3P56539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV3P56539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV3P56539 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV3P56539 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV3P56539 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV3P56539 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV3P56539 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV3P56539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV3P56539 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV3P56539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV3P56539 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAV3P56539 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV3P56539 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAV3P56539 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAV3P56539 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAV3P56539 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAV3P56539 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAV3P56539 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAV3P56539 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAV3P56539 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAV3P56539 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAV3P56539 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAV3P56539 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAV3P56539 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAV3P56539 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAV3P56539 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAV3P56539 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms