Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUDT6P53370 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDT6P53370 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDT6P53370 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT6P53370 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT6P53370 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms