Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA1P52907 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA1P52907 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms