Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB2P52799 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB2P52799 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB2P52799 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms