Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPC3P51654 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC3P51654 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC3P51654 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC3P51654 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC3P51654 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC3P51654 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC3P51654 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC3P51654 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPC3P51654 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC3P51654 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC3P51654 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC3P51654 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPC3P51654 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC3P51654 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC3P51654 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPC3P51654 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC3P51654 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC3P51654 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC3P51654 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC3P51654 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPC3P51654 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC3P51654 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPC3P51654 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC3P51654 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC3P51654 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC3P51654 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPC3P51654 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC3P51654 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC3P51654 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC3P51654 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC3P51654 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC3P51654 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC3P51654 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC3P51654 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC3P51654 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC3P51654 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC3P51654 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC3P51654 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC3P51654 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC3P51654 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC3P51654 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC3P51654 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC3P51654 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC3P51654 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC3P51654 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC3P51654 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC3P51654 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC3P51654 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC3P51654 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC3P51654 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC3P51654 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC3P51654 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC3P51654 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC3P51654 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC3P51654 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC3P51654 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC3P51654 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC3P51654 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC3P51654 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC3P51654 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC3P51654 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC3P51654 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC3P51654 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms