Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNC1P48547 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC1P48547 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC1P48547 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC1P48547 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms