Protein–RNA interactions for Protein: P47897

QARS, Glutamine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARSP47897 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
QARSP47897 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
QARSP47897 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
QARSP47897 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
QARSP47897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
QARSP47897 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
QARSP47897 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
QARSP47897 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
QARSP47897 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
QARSP47897 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
QARSP47897 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
QARSP47897 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
QARSP47897 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
QARSP47897 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
QARSP47897 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
QARSP47897 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
QARSP47897 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
QARSP47897 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
QARSP47897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
QARSP47897 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
QARSP47897 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
QARSP47897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
QARSP47897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
QARSP47897 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
QARSP47897 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
QARSP47897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
QARSP47897 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
QARSP47897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
QARSP47897 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
QARSP47897 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
QARSP47897 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
QARSP47897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
QARSP47897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
QARSP47897 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
QARSP47897 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
QARSP47897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
QARSP47897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
QARSP47897 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
QARSP47897 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
QARSP47897 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
QARSP47897 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
QARSP47897 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
QARSP47897 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
QARSP47897 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
QARSP47897 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
QARSP47897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
QARSP47897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
QARSP47897 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
QARSP47897 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
QARSP47897 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
QARSP47897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
QARSP47897 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
QARSP47897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
QARSP47897 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
QARSP47897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
QARSP47897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
QARSP47897 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
QARSP47897 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
QARSP47897 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
QARSP47897 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
QARSP47897 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
QARSP47897 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
QARSP47897 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
QARSP47897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
QARSP47897 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QARSP47897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
QARSP47897 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
QARSP47897 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QARSP47897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QARSP47897 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QARSP47897 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
QARSP47897 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
QARSP47897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
QARSP47897 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
QARSP47897 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms