Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA2P46019 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHKA2P46019 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHKA2P46019 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKA2P46019 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKA2P46019 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms