Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFMP43652 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFMP43652 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFMP43652 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFMP43652 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFMP43652 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AFMP43652 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFMP43652 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFMP43652 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFMP43652 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFMP43652 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFMP43652 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFMP43652 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFMP43652 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFMP43652 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFMP43652 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFMP43652 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFMP43652 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFMP43652 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFMP43652 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFMP43652 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFMP43652 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFMP43652 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFMP43652 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AFMP43652 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFMP43652 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFMP43652 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFMP43652 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFMP43652 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFMP43652 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFMP43652 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFMP43652 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFMP43652 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFMP43652 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFMP43652 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFMP43652 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFMP43652 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFMP43652 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFMP43652 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
AFMP43652 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFMP43652 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFMP43652 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AFMP43652 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFMP43652 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFMP43652 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFMP43652 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFMP43652 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFMP43652 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFMP43652 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFMP43652 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFMP43652 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFMP43652 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFMP43652 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
AFMP43652 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFMP43652 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFMP43652 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFMP43652 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFMP43652 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFMP43652 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFMP43652 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFMP43652 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFMP43652 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFMP43652 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFMP43652 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFMP43652 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFMP43652 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFMP43652 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFMP43652 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFMP43652 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFMP43652 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFMP43652 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AFMP43652 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFMP43652 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AFMP43652 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms