Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYKP43405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYKP43405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYKP43405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYKP43405 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYKP43405 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYKP43405 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYKP43405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYKP43405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYKP43405 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYKP43405 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYKP43405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYKP43405 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms