Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYKP43405 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYKP43405 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYKP43405 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYKP43405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYKP43405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYKP43405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYKP43405 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYKP43405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYKP43405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYKP43405 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYKP43405 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYKP43405 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYKP43405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYKP43405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYKP43405 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYKP43405 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYKP43405 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYKP43405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYKP43405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYKP43405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYKP43405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYKP43405 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYKP43405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYKP43405 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYKP43405 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYKP43405 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYKP43405 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYKP43405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYKP43405 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYKP43405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYKP43405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYKP43405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYKP43405 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms