Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC1A4P43007 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC1A4P43007 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
SLC1A4P43007 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC1A4P43007 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms