Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC26A3P40879 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC26A3P40879 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC26A3P40879 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC26A3P40879 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms