Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
USP8P40818 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP8P40818 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP8P40818 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP8P40818 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP8P40818 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP8P40818 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP8P40818 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP8P40818 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP8P40818 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP8P40818 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP8P40818 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP8P40818 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP8P40818 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP8P40818 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP8P40818 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP8P40818 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP8P40818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP8P40818 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP8P40818 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP8P40818 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP8P40818 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP8P40818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP8P40818 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP8P40818 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP8P40818 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP8P40818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP8P40818 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP8P40818 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP8P40818 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP8P40818 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP8P40818 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP8P40818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP8P40818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP8P40818 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP8P40818 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP8P40818 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP8P40818 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP8P40818 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP8P40818 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP8P40818 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP8P40818 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP8P40818 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP8P40818 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP8P40818 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP8P40818 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP8P40818 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP8P40818 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP8P40818 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP8P40818 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP8P40818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP8P40818 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP8P40818 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP8P40818 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP8P40818 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP8P40818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP8P40818 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP8P40818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP8P40818 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP8P40818 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP8P40818 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP8P40818 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP8P40818 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP8P40818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP8P40818 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP8P40818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP8P40818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP8P40818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP8P40818 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP8P40818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP8P40818 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP8P40818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP8P40818 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP8P40818 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP8P40818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP8P40818 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP8P40818 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP8P40818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP8P40818 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP8P40818 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP8P40818 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP8P40818 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP8P40818 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms